脳や感覚器官がどのようなしくみで作られ、機能するのかを、発生過程の観察や操作が容易で、遺伝情報も詳しく解明されているホヤとメダカを主なモデル生物として研究を進めている。脊椎動物の起源や、脳や眼がどのように進化してきたのかという謎にも迫ろうとしている。

植物は環境や季節の変化に応じて生体膜の脂質の含量や組成を変える。このような生体膜脂質の可塑性の生物学的機能を明らかにするため、スフィンゴ脂質代謝関連酵素の遺伝子発現制御の観点から研究している。

微細藻類や原生動物など、特に単細胞の真核生物の系統進化および分類。対象生物を野外から採集をすることを第一歩とし、形態および構成物質の比較、分子系統解析などから進化的位置づけを行う。また、これらの生物が環境生態に果たす役割の解明についてもテーマとしている。

タンパク質は独自の立体構造を形成することで、はじめてその機能を発揮することができる。生体内では分子シャペロンと呼ばれる一群のタンパク質が、様々なタンパク質の立体構造形成を助けている。こうした分子シャペロンの働きを分子レベルで解明することを目指して研究を進めている。

多細胞生物において生殖細胞は遺伝情報を次世代に伝える重要な働きを持つ。モデル生物であるショウジョウバエを材料として、生殖細胞中の遺伝子発現制御機構、生殖細胞の分化機構、減数分裂の制御機構、生殖細胞とそれを取り込む体細胞との相互作用に関する研究を遺伝子レベルで進めている。

動物がどうのように環境温度を感じ生体の調節をおこなっているのかを解き明かすために、線虫C. エレガンスをつかって研究しています。具体的には、線虫の温度に対する応答に着目して、(1) 動物の感覚情報処理のメカニズムや、(2) 環境変化への生体適応のメカニズムを解き明かそうとしています。

生命を支える上で必須な細胞内のエネルギーやタンパク質分解の制御。その機構は種を超えて保存されている。さらに理解を深め社会的に意義ある知見を得る為に、単純な酵母細胞をモデルに分子レベルでの解析を行う。

植物の細胞内は、小胞体をはじめとした内膜系や細胞骨格がダイナミックな構築を繰り返している。小胞体の運動のしくみや内膜系と細胞骨格の動態が支える植物の環境適応能力を理解するために、遺伝子レベルから個体レベルまで幅広い視野で研究を進めている。

女王アリは、羽化直後の交尾で受け取った精子を寿命が続く限り貯蔵する。アリの多くの種の女王の寿命は10年以上と、昆虫としては例外的に長寿のため、精子貯蔵期間も極端に長い。この驚くべき能力を分子レベルで解明しようとしている。